Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nfe2l3Q9WTM4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2l3Q9WTM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms