Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Wdr54Q9R0D8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Wdr54Q9R0D8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms