Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nek3Q9R0A5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek3Q9R0A5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek3Q9R0A5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms