Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Col4a3Q9QZS0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3Q9QZS0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3Q9QZS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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