Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas3Q9QZQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms