Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ57

Hspb3, Heat shock protein beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb3Q9QZ57 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb3Q9QZ57 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb3Q9QZ57 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb3Q9QZ57 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspb3Q9QZ57 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hspb3Q9QZ57 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspb3Q9QZ57 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms