Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rdh11Q9QYF1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh11Q9QYF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh11Q9QYF1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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