Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcb11Q9QY30 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcb11Q9QY30 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms