Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip3Q9QXT8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 423.6 ms