Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad18Q9QXK2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad18Q9QXK2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms