Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trp53inp1Q9QXE4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trp53inp1Q9QXE4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms