Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyhr1Q9QXA1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyhr1Q9QXA1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms