Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sall2Q9QX96 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sall2Q9QX96 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall2Q9QX96 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms