Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc5Q9QX29 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms