Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-OaQ9QWV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-OaQ9QWV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms