Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk1eQ9JMK2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk1eQ9JMK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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