Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm2bQ9JME9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2bQ9JME9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms