Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sfmbt1Q9JMD1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms