Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkd2l2Q9JLG4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkd2l2Q9JLG4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms