Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr5Q9JLF7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr5Q9JLF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr5Q9JLF7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 374.7 ms