Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgm1Q9JLF6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tgm1Q9JLF6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tgm1Q9JLF6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Tgm1Q9JLF6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm1Q9JLF6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms