Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nectin3Q9JLB9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin3Q9JLB9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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