Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Upk3aQ9JKX8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Upk3aQ9JKX8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms