Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trem1Q9JKE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trem1Q9JKE2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms