Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms