Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PigbQ9JJQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PigbQ9JJQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PigbQ9JJQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms