Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpn1Q9JJN5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpn1Q9JJN5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms