Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riox1Q9JJF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Riox1Q9JJF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Riox1Q9JJF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.8 ms