Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip1Q9JJ57 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip1Q9JJ57 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip1Q9JJ57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms