Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FliiQ9JJ28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FliiQ9JJ28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms