Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacna1fQ9JIS7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms