Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ercc6l2Q9JIM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms