Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13bQ9ET35 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms