Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Usp29Q9ES63 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp29Q9ES63 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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