Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trhr2Q9ERT2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trhr2Q9ERT2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms