Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim54Q9ERP3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms