Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ripk4Q9ERK0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ripk4Q9ERK0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk4Q9ERK0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms