Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sall1Q9ER74 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sall1Q9ER74 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sall1Q9ER74 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms