Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rapgef4Q9EQZ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms