Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpcn1Q9EQJ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Tpcn1Q9EQJ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tpcn1Q9EQJ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tpcn1Q9EQJ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tpcn1Q9EQJ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tpcn1Q9EQJ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Tpcn1Q9EQJ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpcn1Q9EQJ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpcn1Q9EQJ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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