Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQB9

Znf287, Zinc finger protein 287, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf287Q9EQB9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf287Q9EQB9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Znf287Q9EQB9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf287Q9EQB9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms