Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r47Q9EQ51 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r47Q9EQ51 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms