Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r172Q9EPS4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r172Q9EPS4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms