Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clstn1Q9EPL2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clstn1Q9EPL2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms