Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp3Q9EP97 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Senp3Q9EP97 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms