Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aph1cQ9DCZ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aph1cQ9DCZ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms