Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc38a3Q9DCP2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc38a3Q9DCP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms