Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med29Q9DB91 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms