Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap1s2Q9DB50 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap1s2Q9DB50 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms