Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9DA42 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9DA42 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9DA42 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9DA42 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9DA42 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9DA42 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9DA42 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms